Rad na razvoju GitHub platforme je započet oktobra 2007. godine. Platforma je 10. aprila 2008. godine pokrenuta od strane grupe programera, koju su činili: Tom Preston-Verner, Kris Vanstrat, Pi Džej Hajet i Skot Džekon. Prethodno je platforma pokrenuta kao beta izdanje. GitHub ima svoju godišnju konferenciju koja se zove GitHub Universe. GitHub je u početku funkcionisao kao organizacija ravnopravnih menadžera, međutim sam način plaćanja bio u nadležnosti izvršnog direktora Toma Preston-Vernera, koji je posle niza skandala 2014. godine podneo ostavku.
Februara 2009. godine GitHub je objavio da je u prvih godinu dana postojanja na platformi akumulirano 46 000 javnih skladišta, od kojih je 17 000 bilo iz prethodnog meseca. U to vreme je 6 200 skladišta račvano bar jednom, a 4 200 je spojeno. Tada je platformu koristilo nešto više od 100 000 korisnika, sa 90 000 javnih skladišta, od kojih je 12 000 račvano bar jednom. Već u 2010. godini GitHub je imao preko milion skladišta, a onda je u narednoj godini broj skladišta udvostručen. Do početka 2013. godine GitHub je imao više od tri miliona korisnika sa preko pet miliona skladišta. Krajem iste godine broj skladišta je bio dupliran na 10 miliona. U junu 2022. godine GitHub je imao preko 83 miliona korsnika.
Sedište GitHub-a je u San Francisku. Prva kancelarija GitHub-a koja je otvorena van Sjedinjenih američkih država, bila je u Japanu 2015. godine. Na Forbsovoj Cloud 100 listi za 2016. godinu, na kojoj se svake godine nalazi 100 najboljih kompanija koje koriste računarstvo u oblaku, GitHub platforma zauzimala je 14. mesto.